Projektnews Poem@Home: Preliminary CASP8 evaluation

Struktur der Teams POEM und POEMQA

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Liebe POEM@HOMEler,

wie bereits im englischsprachigen Forenbereich geschrieben, haben wir mit den vorläufigen experimentellen Strukturen auch eine kurze vorläufige Auswertung durchgeführt.
Auf den Graphen weiter unten sieht man die TM-Scores unserer besten Struktur der Teams POEM und POEMQA verglichen mit der besten hochgeladenen Serverstruktur aller Server. Vor allen Dingen mit den POEMQA Ergebnissen sind wir sehr zufrieden, weil bei fast allen Targets ein gutes Ergebnis unter den besten 5 vorzufinden war.

Auch die POEM Gruppe hat im Template Based Modeling Bereich gute Ergebnisse erzielen können; nur im Free Modeling Bereich müssen wir die Methode wohl noch etwas verfeinern.

Wir werden natürlich die Auswertung weiterführen, sobald mehr und mehr experimentelle Strukturen verfügbar sind und berichten hier dann auch über die Ergebnisse.

Also vielen Dank für eure immense Unterstützung, die das erst möglich gemacht hat.

Vorläufige Plots, die die beste hochgeladene Server Struktur mit unserer besten Struktur vergleicht:
Für Targets 389 - 434,
für Targets 437 - 474 und
für Targets 476 - 493.

Hierbei gilt:
Ein TM-Score von 1 bedeutet eine 1:1 Vorhersage der experimentellen Struktur. Aufgrund von Messfehlern kann man aber meist sagen, dass bereits ein TM-Score von 0.9 vollkommen mit der experimentellen Struktur übereinstimmt. TM-Scores unter 0.16 bedeuten eine zufällige Struktur und daher ein sehr schlechtes Ergebnis.

Beste Grüße,
das POEM@HOME Team.

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