Hallo!
Hast du deine HD als eine Partition? Weil Win98 keine Platten über 64GB verwalten kann. Auch, wenn du sie mit PartitionMagic o.ä. formatierst. Du müßtest mind. zwei Partitionen draus machen.
Zu den Via-IDE-Treibern. Diese sind bekannt dafür, dass sie die Performance senken. Du kannst sie ja mal deinstallieren und schauen, ob es besser wird. Ich installiere diese nie.
Ist aber schon merkwürdig, dass deine HD im Gerätemanager nicht erkannt wird. Versuchs mal mit Treiberupdate/aus der Liste auswählen, ob sie dort dabei ist...
Ferrari.