11. Pentathlon 2020 - Rosetta (Marathon)
- Ersteller unterstudienrat
- Erstellt am
cyrusNGC_224
Grand Admiral Special
Das exakte Problem habe ich auch mit allen K10 CPUs. 1090T, X4 810 und ein 12 Kern Opti. Betrifft die SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST.Also entweder hat mein 1090T (Ubuntu 20.04) ein richtiges Problem oder es gibt eine Serie defekter WU´s:
Junior_HalfRoid_design6_cart_COVID-19_SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST...
Werden alle kurz angerechnet und dann mit Rechenfehler abgebrochen. Die Dinger werden gerade in Masse verteilt.
Allerdings hat er andere WUs aktuell in Arbeit ohne Berechnungsfehler...
Keine Ahnung warum. Vielleicht brauchen die AVX (und keiner weiß das, weil es heute jeder hat)...
Maverick-F1
Grand Admiral Special
Kann nicht sein - hab' einige von den "SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST" WUs auf meinen Celerons gesehen - die haben auch kein AVX...
cyrusNGC_224
Grand Admiral Special
Dann liegt es nicht an AVX und ist noch mysteriöser. Naja, dann bleiben halt nur die A_fold_SAVE_ALL_OUT am laufen.
bnoob
Vice Admiral Special
SSE4.1?
--- Update ---
Wir haben übrigens wohl Mitglied Nr. 1000 in unserem Team bekommen!
koschi
Grand Admiral Special
Das Rosetta jetzt die Datenbank nur noch einmal auspackt und nicht mehr jeden Slot damit zuballert ist sicher eine der sinnigsten Verbesserungen der letzten Zeit gewesen.
Stelle gerade um von N2 + NFS storage auf N2 lokal. Es laufen 6 Rosetta WUs, noch 50 auf Halde und trotzdem sind inkl. OS nur 4.4 von 7.0 GB der eMMC belegt. Hurra!
Stelle gerade um von N2 + NFS storage auf N2 lokal. Es laufen 6 Rosetta WUs, noch 50 auf Halde und trotzdem sind inkl. OS nur 4.4 von 7.0 GB der eMMC belegt. Hurra!
erde-m
Grand Admiral Special
Über Nacht hat der 1090T jetzt 17 Wuzen ohne weiter Fehler fertig gebracht. Immerhin 1.100 Credits 
Da sind einige SAVE_ALL_OUTxxx und xxxIGNORE_THE_REST dabei. Allerdings nicht SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST
Die Juniors habe ich konsequent abgebrochen.
Da sind einige SAVE_ALL_OUTxxx und xxxIGNORE_THE_REST dabei. Allerdings nicht SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST
Die Juniors habe ich konsequent abgebrochen.
![:]](https://www.planet3dnow.de/vbulletin/images/smilies/rolleyes.gif "Augen rollen (sarkastisch) :]")
Maverick-F1
Grand Admiral Special
Ist bei mir auch so - der R9 ist leider noch gut mit ibercivis beschäftigt - aber sobald er da durch ist (werde defintiv nicht mehr nachfassen), wird er auch noch ein paar Rosen pflücken..
Krümel
Grand Admiral Special
Ich schwenke auch noch mal 16 Threads von den lieblichen Nummern zum Marathon.
wintermute_3dc
Admiral Special
Maverick-F1
Grand Admiral Special
Es scheint sich ganz langsam auszuwirken - zumindest konnten wir die letzten 2-3h unseren hauchdünnen Vorsprung zu LLT wieder minimalst vergrößern.
Weiter so Jungs!
Mein C2 kriegt leider keine Rosen mehr - jetzt heißt es wieder zuwenig Speicher
(Macht er derweil halt Openpandemics)
Weiter so Jungs!
Mein C2 kriegt leider keine Rosen mehr - jetzt heißt es wieder zuwenig Speicher
(Macht er derweil halt Openpandemics)
skelletor
Grand Admiral Special
Ich schwenke von Amicable auch mal zu den Rosen. 16 Zen2 Threads mehr...
Amicable sehe ich nicht mehr dass wir die 10 Mio noch aufholen - auch wenn uns die 3 Punkte am Ende schmerzlich fehlen könnten...
Amicable sehe ich nicht mehr dass wir die 10 Mio noch aufholen - auch wenn uns die 3 Punkte am Ende schmerzlich fehlen könnten...
sehr hohe Fehlerrate bei mir ("Abgebrochen durch Server"):
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/show_host_detail.php?hostid=3416683
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/show_host_detail.php?hostid=3416683
olsen_gg
Grand Admiral Special
Na super. 38 Gute vs. >116 Schrott. Und das in 10 Tagen mit einem Ryzen 9 3900X. Ich bin so stolz auf mich. Der macht jetzt ein anderes Projekt.
Heißt aber auch, dass ich bei den Rosetten ganz raus bin.
Mann, mann. Hätte ich das nur eher kontrolliert.
Doppel-
Heißt aber auch, dass ich bei den Rosetten ganz raus bin.
Mann, mann. Hätte ich das nur eher kontrolliert.
Doppel-
olsen_gg
Grand Admiral Special
Das muss ich alles erst mal gegenschecken. Ich habe doch die Tage immer was bei durchschnittlich 20-25k/d gesehen.
Das da sind <10k. wann werden die denn gelöscht, jeden Tag?
--- Update ---
Egal. hatte ja schon mal festgestellt, dass es am Besten läuft, wenn man nicht reinschaut. und 10k könnte ja sein, weil ich für NF rosetta pausiert hatte.
Das da sind <10k. wann werden die denn gelöscht, jeden Tag?
--- Update ---
Egal. hatte ja schon mal festgestellt, dass es am Besten läuft, wenn man nicht reinschaut. und 10k könnte ja sein, weil ich für NF rosetta pausiert hatte.
erde-m
Grand Admiral Special
Über Nacht hat der 1090T jetzt 17 Wuzen ohne weiter Fehler fertig gebracht. Immerhin 1.100 Credits
Da sind einige SAVE_ALL_OUTxxx und xxxIGNORE_THE_REST dabei. Allerdings nicht SAVE_ALL_OUT_IGNORE_THE_REST
Die Juniors habe ich konsequent abgebrochen.
Auf dem 3900X produzieren die split_bas_agba Berechnungsfehler so bei 3:50h - also kurz vor Ende .
So langsam wird die Selektion stressig...
skelletor
Grand Admiral Special
Hmm, ich habe auf dem 3800X grad zwei "split_pass_bp_agba" in der Mangel - werde das beobachten und sehen, ob die bei mir auch spirenzien machen.
--- Update ---
Mist, eine ist durch gegangen und immerhin 180 Punkte gebracht, die zweite ist nach knapp 4h abgebrochen -> Berechnungsfehler. Grml!
--- Update ---
Schaut so aus, als wäre einfach der filename zu lang?
--- Update ---
Mist, eine ist durch gegangen und immerhin 180 Punkte gebracht, die zweite ist nach knapp 4h abgebrochen -> Berechnungsfehler. Grml!
--- Update ---
Code:
<core_client_version>7.16.5</core_client_version>
<![CDATA[
<stderr_txt>
command: projects/boinc.bakerlab.org_rosetta/rosetta_4.20_windows_x86_64.exe -abinitio::fastrelax 1 -ex2aro 1 -frag3 00001.200.3mers.index -in:file:native 00001.pdb -silent_gz 1 -frag9 00001.200.9mers.index -out:file:silent default.out -ex1 1 -abinitio::rsd_wt_loop 0.5 -relax::default_repeats 5 -abinitio::use_filters false -abinitio::increase_cycles 10 -abinitio::rsd_wt_helix 0.5 -beta 1 -abinitio::rg_reweight 0.5 -in:file:boinc_wu_zip split_pass_bp_agba--rlx_aln_c1_aln_pass_build.bp_20200508201700.pdb-edge1-4-6_renumbered_obj01_polA-3-5.pdb.blue.bp_20200510073414_0001_0001_fragments_data.zip -out:file:silent default.out -silent_gz -mute all -nstruct 10000 -cpu_run_time 28800 -boinc:max_nstruct 20000 -checkpoint_interval 120 -database minirosetta_database -in::file::zip minirosetta_database.zip -boinc::watchdog -boinc::cpu_run_timeout 36000 -run::rng mt19937 -constant_seed -jran 1651978
Using database: database_357d5d93529_n_methyl\minirosetta_database
WARNING! [COLOR="#FF0000"][B]attempt to create gzipped file ../../projects/boinc.bakerlab.org_rosetta/split_pass_bp_agba--rlx_aln_c1_aln_pass_build.bp_20200508201700.pdb-edge1-4-6_renumbered_obj01_polA-3-5.pdb.blue.bp_20200510073414_0001_0001_fragments_fold_SAVE_ALL_OUT_929561_745_0_r1027261576_0 failed.[/B][/COLOR]
======================================================
DONE :: 1 starting structures 14020.7 cpu seconds
This process generated 19 decoys from 19 attempts
======================================================
BOINC :: WS_max 4.67538e+08
20:02:33 (13916): called boinc_finish(0)
</stderr_txt>
<message>
upload failure: <file_xfer_error>
<file_name>split_pass_bp_agba--rlx_aln_c1_aln_pass_build.bp_20200508201700.pdb-edge1-4-6_renumbered_obj01_polA-3-5.pdb.blue.bp_20200510073414_0001_0001_fragments_fold_SAVE_ALL_OUT_929561_745_0_r1027261576_0</file_name>
<error_code>-240 (stat() failed)</error_code>
</file_xfer_error>
</message>
]]>Schaut so aus, als wäre einfach der filename zu lang?
MagicEye04
Grand Admiral Special
Darum läufts also bei mir so gut dieses Jahr.
Aber nee, der kleine Athlon 5350 war irgendwann leer gelaufen. Den konnte ich nicht anschauen, weil der mit meinem KVM-Switch nicht klarkommt.
Aber nee, der kleine Athlon 5350 war irgendwann leer gelaufen. Den konnte ich nicht anschauen, weil der mit meinem KVM-Switch nicht klarkommt.
So, folgendes rechnet nun noch ein wenig hier mit.
i7-8650U(8T), i3-9100T(4T), i3-9100(4T), i3-8100(4T), R5 3400G(4T), R3 3200G(4T)
Wahnsinn, wenn man Bedenkt, das ein 3950X alles zusammen in die Tasche steckt...
Auf die Intel Kisten habe ich auch Zugriff, die könnten auch bei Bedarf etwas anderes berechnen.
i7-8650U(8T), i3-9100T(4T), i3-9100(4T), i3-8100(4T), R5 3400G(4T), R3 3200G(4T)
Wahnsinn, wenn man Bedenkt, das ein 3950X alles zusammen in die Tasche steckt...
Auf die Intel Kisten habe ich auch Zugriff, die könnten auch bei Bedarf etwas anderes berechnen.
enigmation
Admiral Special
Auch ich hatte Pech mit diesen, nach 7:45h von 8h Abbruch, gänzlich ohne Punkte
https://boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=1180884077
Der Fehler ist auch bei mir derselbe, der Name ist schon arg lang:
Code:
split_pass_bp_agba--rlx_aln_c1_aln_pass_build.bp_20200508201700.pdb-edge1-4-6_renumbered_obj01_polA-3-5.pdb.blue.bp_20200510105447_0001_0001_fragments_fold_SAVE_ALL_OUT_929569_568_0Ähnliche Themen
