Leider zu spät, jetzt habe ich es so gemacht:
sda1 128mb uefi /boot/efi vfat
sda2 128mb /boot ext2 als md0
sda3 15gb / ext4 als md1
Da auf /boot/efi nur wenige kb liegen, müsste das ja eigentlich kein Problem sein das manuell auf die andere Disk zu legen.