Neues deutsches Bioinformatik-Projekt
- Ersteller Sabroe SMC
- Erstellt am
aso das wusste ich nicht. hatte nur gesehen das RNA angelegt ist.
Japp - nach der PM von 2D hab ich Tiku gefragt, daher sollte der Dank an TiKu gehen :
Also von meiner Seiter her - vielen Dank TiKu
schließe ich mich an
indiana_74
Moderator
☆☆☆☆☆☆
Noch habe ich keine Angst vor deinen 54 Schüsseln ....
Was helfen denn 54 Schüsseln
Crashtest
Redaktion
☆☆☆☆☆☆
Indi - damit war seine bis vor einigen Minuten noch "sichtbare" Rechnerflotte gemeint - 54 PCs
Deine Flotte kann ich leider nicht einschätzen - ich tippe mal auch etwa 40-60 PCs oder ?
Deine Flotte kann ich leider nicht einschätzen - ich tippe mal auch etwa 40-60 PCs oder ?
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indiana_74
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indiana_74
Moderator
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Crashtest
Redaktion
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Naklar - ein Core i7 hat doch nur 4 Kerne - Intel sagt doch auch immer: 4C / 8T
Ok die neuen 98xer haben 6C/12T ...
Aber irgendwie sind wir einwenig OT oder ?
Also mal wieder raus aus OT:
Der Server liefert viele neue Wuzen, sodass unser Team einige Plätze gut machen kann 8)
Ok die neuen 98xer haben 6C/12T ...
Aber irgendwie sind wir einwenig OT oder ?
Also mal wieder raus aus OT:
Der Server liefert viele neue Wuzen, sodass unser Team einige Plätze gut machen kann 8)
hat hier irgend jemand etwas anderes behauptet?
indiana_74
Moderator
☆☆☆☆☆☆
Crashtest
Redaktion
☆☆☆☆☆☆
hat hier irgend jemand etwas anderes behauptet?
Naja der Indi hat gepostet:
Ein i7 ist ein Quad
Daher meine Reaktion ... wobei es ja nunmehr auch 6-Kern-CorEier gibt
zurück zum Fred:
Unser Team könnte noch ein wenig aufdrehen - es ist ja:
- ein Deutsches Projekt (großteils)
- ein "nützliches" Bio-Projekt
- hat ne gute FAQ
wenn es weiter so gut läuft, sollten wir es evtl. im Sommer mal zum PdM bzw für ein kleines Rennen (=! Race ggf aber auch == Race ) verwenden oder ?
indiana_74
Moderator
☆☆☆☆☆☆
Da hab ich doch glatt den
vergessen. Bevor das Projekt an einem PdM oder Race teilnimmt muss aber an der WU-Anzahl noch was gemacht werden
Auch ein Indy kann Ironisch sein, kommt zwar selten vor, aber es Passiert
Crashtest
Redaktion
☆☆☆☆☆☆
Das Projekt fängt ja gerade erst an ... ich hab doch nicht aus Spaß im Sommer getippt ...
Aber da wir ja die Betreiber kennen und bisher keine Probleme mit den Leuten von Rechenkraft hatten - mache ich mir auch keine großen Sorgen ...
Derweil wächst unser kleines Team, unser Output und auch die Wuzenzahl aufm Server
Aber da wir ja die Betreiber kennen und bisher keine Probleme mit den Leuten von Rechenkraft hatten - mache ich mir auch keine großen Sorgen ...
Derweil wächst unser kleines Team, unser Output und auch die Wuzenzahl aufm Server
Nicht nur. RNAWorld ist das erste eigene DC-Projekt von RKN, mit Kooperationspartnern an der Uni Marburg und dem Indian Institute of Science. Und zwar von der Entwicklung des Projekts über die Erstellung der WUs bis hin zur Auswertung. 8)
RKN war ursprünglich eine reine Community, hat seine Aktivitäten dann ab 2008 in den Bereich der Forschungsförderung erweitert (also wie von heavy-Ions angesprochen: Förderung bestehender Projekte) und ist mit RNAWorld erstmals selbst als Forschungsinstitution aktiv (die bestehenden Tätigkeitsbereiche bleiben natürlich erhalten).
Hier der Rechenschaftsbericht 2008, in dem erste Schritte in diese Richtung bekanntgegeben wurden:
http://www.rechenkraft.net/wiki/images/2/22/Rechenschaftsbericht_2008.pdf
Im Rechenschaftsbericht 2009, der zur nächsten Mitgliederversammlung veröffentlicht wird, wird dann auf die aktuelle Entwicklung eingegangen.
Erste Früchte gibt es bereits, letztes Jahr hat der Verein an folgender wissenschaftlichen Veröffentlichung mitgewirkt, die es immerhin auf die Titelseite von Molecular Biology geschafft hat
:Impact of rRNA methylations on ribosome recycling and fidelity of initiation in Escherichia coli
Sabroe SMC
Grand Admiral Special
Hut ab. Das macht RKN schon klasse
yoyo
Commodore Special
Wir freuen uns auch über tatkräftige Mithelfer (mal vom Crunchen abgesehen), sei es als Mitglied im Verein, als Sponsor, als Programmierer, als Designer von Grafiken/Plakaten/Postern. Und um das Klarzustellen, man muss dazu NICHT im Rechenkraft.net Team rechnen und kann in seinem existierenden Team bleiben.
yoyo
yoyo
Emploi
Grand Admiral Special
Zustimm!
BTW: CIndex nicht vergessen
BTW: CIndex nicht vergessen
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indiana_74
Moderator
☆☆☆☆☆☆
Nicht nur. RNAWorld ist das erste eigene DC-Projekt von RKN, mit Kooperationspartnern an der Uni Marburg und dem Indian Institute of Science. Und zwar von der Entwicklung des Projekts über die Erstellung der WUs bis hin zur Auswertung. 8)
RKN war ursprünglich eine reine Community, hat seine Aktivitäten dann ab 2008 in den Bereich der Forschungsförderung erweitert (also wie von heavy-Ions angesprochen: Förderung bestehender Projekte) und ist mit RNAWorld erstmals selbst als Forschungsinstitution aktiv (die bestehenden Tätigkeitsbereiche bleiben natürlich erhalten).
Hier der Rechenschaftsbericht 2008, in dem erste Schritte in diese Richtung bekanntgegeben wurden:
http://www.rechenkraft.net/wiki/images/2/22/Rechenschaftsbericht_2008.pdf
Im Rechenschaftsbericht 2009, der zur nächsten Mitgliederversammlung veröffentlicht wird, wird dann auf die aktuelle Entwicklung eingegangen.
Erste Früchte gibt es bereits, letztes Jahr hat der Verein an folgender wissenschaftlichen Veröffentlichung mitgewirkt, die es immerhin auf die Titelseite von Molecular Biology geschafft hat
Impact of rRNA methylations on ribosome recycling and fidelity of initiation in Escherichia coli
Herzlichen Dank für diesen ausführlichen Bericht
Echt Klasse was ihr auf die Beine stellt.
Emploi
Grand Admiral Special
RNA ist bisher sehr vorbildlich umgesetzt 
Leider hatte ich gerade 3 Redundant-Resultate, keine Ahnung warum, aber sie wurden von Server gecancelled, obwohl ich Beide als erstes ausgeliefert bekommen habe
gut die 6 anderen Rechner waren eher fertig, aber mein Atom ist halt nicht so schnell...
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=103120
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=98368
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=98363
Leider hatte ich gerade 3 Redundant-Resultate, keine Ahnung warum, aber sie wurden von Server gecancelled, obwohl ich Beide als erstes ausgeliefert bekommen habe
gut die 6 anderen Rechner waren eher fertig, aber mein Atom ist halt nicht so schnell... http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=103120
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=98368
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=98363
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indiana_74
Moderator
☆☆☆☆☆☆
Plant ihr einen GPU Client? Da hätten wir hier jemand der vielleicht helfen könnte.
Leistung hätten wir dann auch im Überfluß für euch
Crashtest
Redaktion
☆☆☆☆☆☆
CIndex nicht vergessen
Ich hab immerhin die 1. Wuze / Kiste im Projekt im Cindex eingetragen - nunmehr sind alle 3 aktive Kisten drin
GPU Client - wäre schön (aber wenn bitte in CAL und CUDA - noch nicht OpenCL)
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JKuehl
Grand Admiral Special
Leider hatte ich gerade 3 Redundant-Resultate, keine Ahnung warum, aber sie wurden von Server gecancelled, obwohl ich Beide als erstes ausgeliefert bekommen habe
Es gilt:
1) die WU wird an 3 Rechner verteilt
2) die ersten beiden die zurückliefern bekommen credits
3a) Falls Kontakt zum Server stattfindet und ein Resultat wurde 2x abgeliefert, aber noch nicht begonnen wird abgebrochen - 0 Sekunden Berechnung, 0 Credits
3b) falls schon begonnen wurde zu berechnen, wird die WU zuende gerechnet und es gibt credits.
Du rechnest also keine Sekunde ohne Credits. Der einzige "Nachteil" der entsteht ist die höhere Bandbreitenlast da ggf. WUs runtergeladen werden die dann nicht berechnet werden sondern verfallen.
Siehe hierzu auch die vorbildliche FAQ
Englisch
http://www.rechenkraft.net/wiki/ind...t_result.22.2C_what_exactly_does_that_mean.3F
Deutsch
http://www.rechenkraft.net/wiki/ind...utet_die_Mitteilung_.22redundant_result.22.3F
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