Natürlich kann man auch unter SkyOS neue Programme installieren. Am komfortabelsten geht das über den Software Store. Dieses Tool listet alle auf einem zentralen Server verfügbaren aktualisierten bzw. neuen Programmpakete auf; die Installation eines Pakets erfordert nicht mehr als wenige Mausklicks.
Eine Alternative zum Software Store stellt das Kommandozeilenprogramm factory dar. Auch mit diesem Tool gestaltet sich die Softwareinstallation einfach. Liegt ein Programm nur im Quellcode vor, kann es von factory automatisch kompiliert werden.
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